基围虾出现蓝色、黄色的不同外观，主要是品种差异、生长环境色素沉淀、新鲜度存储状态不同这三个原因导致的，两种颜色只要没变质都可正常食用。
1. 品种差异。市面上标注“基围虾”的虾其实包含两个常见品种，传统意义上的基围虾是刀额新对虾，不少野生个体天生就带浅蓝色的虾壳；现在市面上更常见的是把养殖凡纳滨对虾（南美白对虾）当作基围虾售卖，这个品种天生虾壳就偏浅黄，这是最常见的原因。
2. 生长环境带来的色素沉淀。哪怕是同一个品种的基围虾，生长环境不同也会改变外壳颜色：野生基围虾长期生活在带藻类的近海区域，日常摄入的藻类含有藻蓝素，这种色素会慢慢沉积在虾壳上，让虾壳整体偏蓝；而全程人工养殖的基围虾吃标准化配合饲料，生长环境很少有大量野生藻类，不会额外积累蓝色色素，虾壳自然就偏黄。
3. 新鲜度和存储状态的影响。基围虾外壳的色素性质不稳定，很容易氧化变化：刚捕捞上来的新鲜基围虾，原本的蓝色会保留得很完整，如果放置时间过长或者冷冻存储过久，蓝色素会慢慢氧化分解，原本偏蓝的虾壳就会逐渐褪成黄色，这也是同一批货也可能出现两种颜色虾的常见原因。
