肠道细菌可以合成许多维生素，包括：
1. 维生素B1 (硫胺素)
2. 维生素B2 (核黄素)
3. 维生素B3 (烟酸/烟酰胺)
4. 维生素B5 (泛酸)
5. 维生素B6 (吡哆醇)
6. 维生素B7 (生物素)
7. 维生素B9 (叶酸)
8. 维生素B12 (氰钴胺)
9. 维生素K2 (甲基维生素K)
10. 维生素H (生长因子)
目前临床上并没有统一标准能明确界定肠道益生菌缺乏多少，不同个体的肠道菌群基线差异极大，只能辅助判断是否存在益生菌失衡。
