肠道内益生菌种类繁多，目前已知的肠道内益生菌种类超过1000种。其中较为常见的包括双歧杆菌属（如双歧杆菌、长双歧杆菌等）、乳酸杆菌属（如嗜酸乳杆菌、短小乳杆菌等）、双歧链球菌属（如双歧链球菌B群等）、芽孢杆菌属（如屎肠球菌、硝酸盐还原屎肠球菌等）等。不同种类的益生菌对人体的益处也有所不同。
1.重量范围：正常成年人肠道内有益菌的重量通常在100克到300克之间，远低于1000克。2.数量级：肠道内有益菌的数量以“菌落形成单位”计量，通常达万亿级别。例如，健康成人肠道内约有100万亿个微生物细胞，其中有益菌占10%-20%，即约10-20万亿个。
