肠道菌群主要主导了人体三大核心生理过程，分别是营养转化吸收、免疫稳态维持和代谢状态与慢性疾病风险调控。
1 主导营养的转化与吸收。我们吃进去的全谷物、蔬菜里的膳食纤维、抗性淀粉，人体自身的消化酶根本分解不了，这些物质进入肠道后，全靠共生的肠道菌群把它们发酵分解成短链脂肪酸这类能被人体吸收利用的能量物质，除此之外，肠道菌群还能合成人体没法自主生成的B族维生素、维生素K等必需营养素，相当于帮我们打通了饮食里“隐性营养”的利用通道，一顿饭吃进去的营养能被吸收利用多少，很大程度由肠道菌群的构成决定。
2 主导全身免疫稳态的维持。肠道是人体z大的免疫器官，将近七成的免疫细胞都聚集在肠道黏膜周围，肠道菌群首先会通过“占位”挡住外界有害致病菌在肠道黏附入侵，相当于给肠道内壁铺了一层只有“自己人”能待的保护膜；其次共生菌群还会从小刺激免疫系统发育成熟，训练免疫细胞区分自身物质和外来异物，避免免疫系统错攻自身组织，从根源降低过敏、自身免疫病的发作概率。
3 主导代谢状态与慢性疾病的发生风险。现在已经有大量研究证实，肥胖、2型糖尿病、非酒精性脂肪肝这些常见的慢性病，都和肠道菌群结构失衡直接相关。结构紊乱的菌群会提升人体对多余能量的储存效率，让你吃同等量的食物也更容易长肉，还会扰乱胰岛素敏感性，让身体长期处于低炎症状态，推高血压、血脂异常的发生概率；而健康的肠道菌群能帮人体维持血糖血脂稳定，从长期降低各类慢性病的发病风险。
